中华流行病学杂志  2014, Vol. 35 Issue (11): 1289-1291   PDF    
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2014.11.026
中华医学会主办。
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丁奕博, 王鹏. 2014.
Ding Yibo, Wang Peng. 2014.
鼠疫耶尔森菌质粒种类、功能及其流行病学意义
Plasmid types, functions of Yersinia pestis and their epidemiological significance
中华流行病学杂志, 2014, 35(11): 1289-1291
Chinese Journal of Epidemiology, 2014, 35(11): 1289-1291
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2014.11.026

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投稿日期:2014-6-19
鼠疫耶尔森菌质粒种类、功能及其流行病学意义
丁奕博1, 王鹏2     
1 671000 大理学院公共卫生学院;
2 云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室
关键词鼠疫耶尔森菌     质粒    
Plasmid types, functions of Yersinia pestis and their epidemiological significance
Ding Yibo1, Wang Peng2     
1 School of Public Health, Dali University, Dali 671000, China;
2 Yunnan Provincial Key Laboratory for Zoonosis Control and Prevention, Yunnan Institute for Endemic Disease Control and Prevention
Key words: Yersinia pestis     Plasmid    

质粒是鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)染色体外的遗传物质,大 多数鼠疫菌都带有3 个质粒:pMT1(pFra/pYT)、pCD1(pYV) 及pPCP1(pPst/pPCY1/pPla/pYP)[1],是鼠疫菌毒力的重要组 成部分,在抗吞噬及侵入扩散中扮演重要角色。除上述质粒 外,国内外还陆续报道了一些其他质粒,这些质粒对鼠疫菌 自身特性及遗传进化具有特殊的意义。本文就鼠疫菌质粒 的种类、功能及其流行病学意义进行概述。

1. 鼠疫菌3 种常规质粒:pCD1 为耶尔森菌菌属3 种致病 菌(鼠疫菌、假结核菌及小肠结肠炎菌)所共有的,约为70 kb (45 mDa),功能主要为编码低钙反应刺激元件(LCRS),包括 1 个专用的多蛋白分泌系统(Ⅲ型分泌系统)和多个控制分泌 性毒力蛋白表达的调节基因。质粒pPCP1 和pMT1 则是在 鼠疫菌由假结核耶尔森菌进化而来时,通过基因水平转移获 得[2]。pMT1 质粒约为100 kb(65 mDa),主要编码F1 荚膜抗 原和磷脂酶D(鼠毒素);其中F1 荚膜抗原具有抗吞噬的功 能,保护鼠疫菌不受中性粒细胞和单核细胞吞噬,磷脂酶D 与鼠疫在传播媒介蚤中菌栓的形成相关[3],在鼠疫菌的传播 扩散中起重要作用。pPCP1 质粒一般为9.5 kb(6 mDa),主要 编码血浆酶原活化因子(Pla)和鼠疫巴氏杆菌素(Pst),其中 Pla 蛋白在鼠疫菌从感染部位向淋巴结的扩散具有重要的促 进作用[4]

2. 其他鼠疫菌质粒:

(1)质粒pG8786:格鲁吉亚高加索鼠疫疫源地菌株Yersinia pestis G8786 所携带[137 kb(91 mDa)],该质粒除了 含有pMT1 质粒的骨架外,还多了4 642 bp 和32 617 bp 的2 个区域,前者与伤寒沙门菌质粒pHCM2 高度同源,后者与F 质粒的转移基因高度同源;推测该质粒具有一定的转移性, 极有可能是pMT1 质粒群中的1 个古老形式[5]

(2)质粒pIP1202:1995 年分离自马达加斯加1 例腺鼠疫 患者的鼠疫菌株Y. pestis IP275 所携带[183 kb(122 mDa)], 是1 个自身可传播的多重耐药质粒,对包括链霉素、四环素、 氯霉素和磺胺类药物等推荐用于鼠疫预防和治疗药物具有 耐药性[6]

(3)质粒pJARS35 和pJARS36:1 株分离自印度尼西亚 的不表达F1 抗原的鼠疫菌株Y. pestis Java 9 所携带[35 kb (23 mDa)]和[36 kb(23 mDa)],这2 个质粒含有4 型接合转 移系统,该系统可能来源于昆虫寄生的一种气单胞菌 (Aeromonas culicicola)和大肠埃希菌pR6K;该种气单胞菌最 初分离自吸血的蚊虫,提示昆虫中胃可能是鼠疫基因组进化 中基因水平转移1个合适的环境[7]

(4)质粒pCRY:在中国分离的布氏田鼠鼠疫菌株中发 现的1 个新质粒[22 kb(15 mDa)],该质粒编码细菌的4 型分 泌系统[8]

(5)质粒pYC:中国南方黄胸鼠疫源地一些鼠疫菌中存 在的特殊质粒[6 kb(4 mDa)],序列分析表明[9],pYC质粒含 有2 个基因区,共有12 个ORF 结构,其中,ORF1 与Neisseria gonorrhoear 产生β-内酰胺酶的质粒pFA3 的复制起始蛋白 相似,ORF10 和ORF11 与大肠埃希菌染色体DNA 的DinJ1 和DinJ2 高度同源;通过携带该质粒与不携带该质粒菌株 的蛋白质分析发现,具有pYC 质粒的菌株多出1 个伴侣蛋 白簇[10]。然而,该质粒的真正功能尚不清楚,因而构建该 质粒的缺失株,与其自然分离株进行比较研究是进一步研 究的方向。

除此之外,还在一些菌株中发现了质粒的嵌合或聚合体 形式。在测序的安哥拉鼠疫菌株(Yersinia pestis Angola)中, 发现了114 570 bp 的pMT-pPCP 质粒,其是由1 个pMT1 的骨 架与2 个pPCP1 质粒的拷贝连接而成的,值得注意的是该质 粒缺失了caf 基因簇,从而使该菌株成为一株F1 抗原缺失的 菌株。此外,美国西部的亚利桑那州、加利福尼亚州、科罗拉 多州、新墨西哥州和得克萨斯州的鼠疫菌株中携带1 个大小 19 kb(12 mDa)的质粒,经实验证实该质粒是9.5 kb(6 mDa) 质粒(pPCP1质粒)的二聚体[11]

3. 中国发现的鼠疫菌质粒及其分布情况:除3 种常规质 粒外,在中国已发现15 种大小不同的鼠疫菌质粒(表 1),其 中绝大多数未进一步研究。

表 1 中国鼠疫菌质粒组成地理分布(Mr=106

从质粒种类上看,云南鼠疫菌存在的质粒种类最多,达 到10 种[12, 13, 14];西藏次之,含有9 种质粒类型;新疆鼠疫菌含有 7 种质粒类型[15];广西鼠疫菌含有6 种质粒类型[16];青海鼠疫 菌含有5 种质粒类型[17];而吉林只有3 种常规质粒。

从地理分布上看,除3 种常规质粒外,138 kb(92 mDa)质 粒在中国分布较为广泛,报道质粒的9 个省份中有4 个即西 藏、新疆、青海及广西有分布;13 mDa质粒在宁夏[18]、河北及 内蒙古3 个省份有分布。6 kb(4 mDa)质粒即pYC质粒是黄 胸鼠鼠疫疫源地(云南、广西及福建等地区)独有的质粒类型。

4. 鼠疫菌质粒的流行病学意义:

(1)鼠疫菌溯源的意义:特定的鼠疫菌质粒图谱有特定 的地理分布,可以为鼠疫菌的溯源提供线索。通过时间空间 的观察和分子生物学研究,国内外普遍认为质粒在一定时间 和有限地区是稳定并且特异的[12],其原因可能是鼠疫菌拥有 pMT1 质粒,可产生荚膜F1 抗原,不易接受外界的质粒进入 菌体,因此以质粒为依据,结合鼠疫菌的生化特征,判断鼠疫 菌归属的鼠疫疫源地,可作为鼠疫疫源地划分的重要指标。 董兴齐等[19]在研究云南家鼠鼠疫来源时,通过检测家鼠和野 鼠的质粒谱,发现其携带的规范化质粒不仅分子质量无差 别,而且都有Ⅴ型质粒图形(多为111 mDa质粒)变异株,提 示具有相同的遗传变异性,推测云南家鼠鼠疫可能源于云南 野鼠鼠疫。还有研究表明,河北省的鼠疫菌大多携带20 kb (13 mDa)质粒,而该质粒是内蒙古长爪沙鼠疫源地菌株所特 有的,因而进一步说明河北的鼠疫疫源地是内蒙古长爪沙鼠 疫源地的一部分[20]

(2)质粒序列信息对鼠疫菌遗传进化的意义:质粒是一 种可移动的遗传信息,在菌株的遗传进化中扮演着十分重要 的角色。假结核菌在进化过程中正是水平获得了2 个质粒 (pPCP1 和pMT1)才进化为高致病性的鼠疫菌[2]。在已测序 的鼠疫菌其他质粒中,有的编码抗性,有的编码分泌系统,有 的编码接合转移系统,它们都与鼠疫菌的遗传进化息息相 关。还有些质粒提供了鼠疫菌基因交换场所的信息,还有些 质粒可能是鼠疫菌进化不同时期的状态,对鼠疫菌质粒的深 入研究为了解鼠疫菌的遗传进化具有重要意义。更为重要 的是,迄今许多鼠疫菌新的质粒并未进行测序,这些质粒信 息中包含着更为有价值的鼠疫菌遗传进化信息。

5. 展望:质粒在鼠疫菌进化史中起到了至关重要的作用,对于未知质粒的研究很可能发现鼠疫菌在遗传进化及特 殊毒力来源的新证据,有助于分析鼠疫菌的来源、地区性和 种类,更好地实现溯源。目前我国已发现十多种特殊大小的 质粒,而这些质粒的序列如何,又有何功能,有待进一步研究 探讨。从质粒分布来看,云南省鼠疫菌质粒的种类最为丰 富,除对6 kb(4 mDa)质粒即质粒pYC进行了鉴定,还有6 种 乃至更多没有发现的质粒至今未能深入研究。

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