中华流行病学杂志  2015, Vol. 36 Issue (9): 1041-1042   PDF    
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2015.09.033
中华医学会主办。
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周健明, 陈应坚, 李静媚, 金玉娟, 杨慧, 甘莉萍, 刘渠.
Zhou Jianming, Chen Yingjian, Li Jingmei, Jin Yujuan, Yang Hui, Gan Liping, Liu Qu.
深圳市龙岗区首次本地登革热暴发疫情的分子流行病学研究
Molecular epidemiological characteristics of the first local dengue fever outbreak in Longgang district, Shenzhen
中华流行病学杂志, 2015, 36(9): 1041-1042
Chinese Journal of Epidemiology, 2015, 36(9): 1041-1042
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2015.09.033

文章历史

投稿日期: 2015-02-03
深圳市龙岗区首次本地登革热暴发疫情的分子流行病学研究
周健明, 陈应坚, 李静媚 , 金玉娟, 杨慧, 甘莉萍, 刘渠    
518172 深圳市龙岗区疾病预防控制中心
关键词: 暴发     系统进化树    
Molecular epidemiological characteristics of the first local dengue fever outbreak in Longgang district, Shenzhen
Zhou Jianming, Chen Yingjian, Li Jingmei , Jin Yujuan, Yang Hui, Gan Liping, Liu Qu    
Longgang District Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen 518172, China
Key words: Outbreak     Phylogenetic tree    

登革热是广东省重点应对的虫媒病毒性疾病[1]。2014年9月27日,深圳市龙岗区首次出现由本地登革热感染病例引起的暴发,本研究对疫情状况及其病原的分子流行病学特征进行研究。

1.材料与方法:

(1)流行病学调查:参照《登革热诊断标准》(WS 216-2008)对病例进行诊断,按照《登革热疫情现场调查处理规范(2006)》收集病例个案调查表及流行病学调查资料,采集病例急性期血清进行登革病毒(DENV)抗体IgM (试剂为中山生物工程有限公司产品)和DENV-1~4型病毒核酸检测(试剂为上海之江生物科技有限公司产品),并开展媒介调查。

(2)病毒分离与滴度测定:血清接种至单层C6/36细胞中,置于28℃、5% CO2培养箱培养7 d,出现细胞病变(CPE)为阳性,连续盲传3代仍无CPE为阴性。将C6/36细胞传代至96孔板中,取分离成功的病毒悬液用维持液连续稀释8个滴度至10-8,每稀释度接种4孔,每孔100 μl,并设对照孔,37℃,5% CO2培养96 h后逐日观察CPE,按照Reed-Muench法计算50%组织细胞病毒感染量(TCID50)。

(3) RT-PCR扩增:选用日本TaKaRa公司的Prime Script RT-PCR试剂盒进行RT-PCR,参照说明书,利用Random 6 mers为引物制备cDNA,取4 μ l为模板,以DV-816F (CTC TGA GAC ACC CAG GAT TCA C)和DV-2598R (GCT GAT CGAATT CCA CAC AC)为引物,扩增DENV的E区段基因(1 782 bp),反应结束后,2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增片段,预测大小为1 782 bp,测序由英潍捷基(上海)公司完成。

(4)序列测定与分析:应用BioEdit软件对测序结果进行拼接,以DNAstar软件中的MegAlign插件和Mage 4.1软件分别进行同源性分析并构建系统进化树(邻接法)。

2.结果:

(1)疫情概况:2014年9月27日至10月2日,龙岗区某工地共确诊DENV-1型感染病例7例(SZ2014LG01~07),均为男性,无外出史,至10月11日未出现新增病例。

首例确诊病例(SZ2014LG01)为工程师,9月21日发热、头痛、乏力,就医未见好转,27日检出DENV核酸及抗体IgM。9月29日至10月2日对工地在职员工174人进行排查,共确诊4例病例(SZ2014LG02~SZ2014LG05),均为建筑工人。SZ2014LG04于9月6日发病,为最早出现临床症状的首发病例,未进行治疗继续工作,29日血清学检测IgM为阳性后隔离治疗。对9月27日前离职员工进行追踪,分别在南山区和罗湖区发现2例病例(SZ2014LG06、SZ2014LG07),离职前一直为该工地建筑工人,SZ2014LG06于18日离开龙岗前往南山工作,22日出现发热症状,28日确诊为登革热;SZ2014LG07于25日离开工地,27日出现临床症状,10月1日确诊。

(2)媒介监测结果:建材堆放处与在建楼盘地下车库的排水明渠是主要的蚊虫孳生地。9月27日(疫点消毒和杀菌)、30日和10月3、6日,对工地及周边小区进行伊蚊幼虫监测,布雷图指数分别为8.6、6.8、4.5、3.2。

(3)病毒分离与滴度:血清样本用C6/36细胞进行病毒分离,2份(SZ2014LG01、04)成功分离出病毒,分别在第一代4 d和3 d出现CPE,TCID50分别为10-5.3/0.1 ml和10-6.8/0.1 ml。

(4) E基因序列分析:采用RT-PCR对确诊患者血清进行DENV核酸检测,4份(SZ2014LG01、SZ2014LG02、SZ2014LG04、SZ2014LG05)获得E区基因核苷酸序列,BioEdit软件拼接整理后长度为1 485 bp,核苷酸序列相似性为100.0%,未发现碱基缺失和插入。首例确诊病例SZ2014LG01与国内外不同时期的DENV-1型代表株进行同源性比对(表 1),核苷酸同源性为90.8%~99.6%,推导氨基酸为96.2%~100.0%,与东莞市分离株D13459/Donguang/2013的同源性最高(核苷酸:99.6%,氨基酸:100.0%)。SZ2014LG01的E基因推导氨基酸序列与DENV-1型代表株相似,含有2个糖基化位点,分别位于第67~69位(NTT)和153~155位(NET),其中3个毒力位点[2]E44(E)、E156(T)和E366(N)均无改变。根据Goncalvez等[3]对DENV-1的分型原则,构建龙岗分离株(SZ2014LG01)与5个基因型代表株的系统进化树(图 1),龙岗株SZ2014LG01与东莞市分离株D13459/Donguang属同一个进化分支(Ⅴ型)。

表 1 深圳市龙岗区DENV-1型SZ2014LG01株与国内外部分毒株E基因同源性比较
图 1 深圳市龙岗区DENV-1型病毒SZ2014LG01株E基因系统进化树

3.讨论:本起疫情的病例分布具有明显聚集性,患者以建筑工人为主(85.7%),查阅本街道未发现其他本地或输入性病例;疫情持续时间较短(26 d),呈现单峰流行趋势,9月6日首发病例出现后,在22、23、27日出现1个发病高峰(4例),29日起迅速对患者进行隔离治疗,并筛查密切接触者,对疫点进行消毒、杀菌和灭蚊,10月1日出现2例新增患者后未出现二代病例;9月6-27日该地区午间室外温度为(30± 4)℃,工地工人(包括患者SZ2014LG02~07)习惯在阴凉潮湿的地下车库午休并反映有蚊虫叮咬经历,而车库内明渠存在严重幼蚊孳生情况,提示地下车库是重要的暴露因素,初步判断此为本地感染病例引起的聚集性登革热暴发疫情。1985-2007年,深圳市出现的登革热病例以输入性为主,未出现本地感染病例[4],2010年才首次出现由本地感染病例引起的登革热暴发[5],病原为DENV-1。与其相似,本次疫情7例登革热病例均由DENV-1引起,提示深圳市本地感染的优势型可能为DENV-1型。

1985-2010年,广东DENV-1流行株以基因Ⅰ型为主(1997、1999、2003),Ⅳ型(1991、1995)和Ⅴ型(1985、2006)交替出现[1];本研究进化树分析显示,2010年深圳本地流行株(D10102-SZ)与2013年广州流行株(GZ28/2013,GZ/25559/2013)为DENV-1基因Ⅰ型,而本疫情病原均为基因Ⅴ型,与2013年东莞市分离株D13459/Donguang属同一进化分支,提示2010年后广东地区DENV-1的基因型流行趋势未见明显改变。同源性分析显示,龙岗株SZ2014LG01与东莞株D13459/Donguang同源性最高,而两地地理相邻,人流物流频繁,不排除本疫情的病原源自东莞市。

参考文献
[1] Wu JY, Lun ZR,James AA, et al. Dengue fever in mainland China [J]. Am J Trop Med Hyg,2010,83(3):664-671.
[2] Puri B, Nelson WM, Henchal EA, et al. Molecular analysis of dengue virus attenuation after serial passage in primary dog kidney cells [J]. J Gen Virol,1996,77(Pt 9):2287-2291.
[3] Goncalvez AP, Escalante AA, Pujol FH, et al. Diversity and evolution of the envelope gene of dengue virus type 1[J]. Virology,2002,303(1):110-119.
[4] Zhang FC, Yang ZC. Dengue fever [M]. Beijing: Science Press, 2008:5-7. (in Chinese) 张复春, 杨智聪. 登革热[M]. 北京:科学出版社,2008:5-7.
[5] Yang F, Guo GZ, Chen JQ, et al. Molecular identification of the first local dengue fever outbreak in Shenzhen city,China: a potential imported vertical transmission from Southeast Asia? [J]. Epidemiol Infect,2014,142(2):225-233.