中华流行病学杂志  2021, Vol. 42 Issue (3): 427-432   PDF    
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.cn112338-20201027-01285
中华医学会主办。
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孙亚敏, 刘锋, 蔡伟, 王磊, 刘方遥, 李玉莲, 王菊光, 应华清, 富继业.
Sun Yamin, Liu Feng, Cai Wei, Wang Lei, Liu Fangyao, Li Yulian, Wang Juguang, Ying Huaqing, Fu Jiye
北京市某市场新型冠状病毒肺炎相关聚集性疫情传播链分析
Transmission chains of clusters of COVID-19 associated with a market in Beijing
中华流行病学杂志, 2021, 42(3): 427-432
Chinese Journal of Epidemiology, 2021, 42(3): 427-432
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.cn112338-20201027-01285

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收稿日期: 2020-10-27
北京市某市场新型冠状病毒肺炎相关聚集性疫情传播链分析
孙亚敏 , 刘锋 , 蔡伟 , 王磊 , 刘方遥 , 李玉莲 , 王菊光 , 应华清 , 富继业     
北京市海淀区疾病预防控制中心 100094
摘要: 目的 调查北京市海淀区某商品交易市场(Y市场)相关新型冠状病毒肺炎(COVID-19)聚集性疫情,分析其传播链及传播模式,为COVID-19疫情防控提供参考依据。方法 采用现场流行病学和聚集性疫情调查方法,描述COVID-19病例三间分布等流行病学特征,绘制病例发病时序图和分析传播链。采集调查对象呼吸道标本,采用实时荧光RT-PCR法进行新型冠状病毒核酸检测。结果 本次COVID-19聚集性疫情的感染来源于北京市丰台区某农产品批发市场(X市场),由Y市场1名从业人员暴露于X市场引发,随后在Y市场、周边社区、美食城、公司、家庭等地导致8起聚集性疫情,共报告关联性COVID-19确诊病例20例,无症状感染者1例。发病时间主要集中在6月10-14日,男性8例,女性13例;年龄中位数为45岁,年龄范围5~87岁;首发症状以发热(10/20)、咽部不适(7/20)为主;潜伏期中位数5(IQR:3~8)d;代间距中位数5 d;续发率3.7%(20/538),家庭密切接触者续发率14.0%(7/50)。结论 Y市场COVID-19疫情是通过被污染环境、物品、人员接触等多种暴露方式导致的聚集性疫情,北京市海淀区通过综合防控措施使COVID-19疫情得到有效控制。
关键词: 新型冠状病毒肺炎    聚集性疫情    传播链    
Transmission chains of clusters of COVID-19 associated with a market in Beijing
Sun Yamin , Liu Feng , Cai Wei , Wang Lei , Liu Fangyao , Li Yulian , Wang Juguang , Ying Huaqing , Fu Jiye     
Haidian District Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100094, China
Abstract: Objective To investigate the clusters of COVID-19 associated with a market (market Y) in Haidian District, Beijing, and analyze the chain of transmission and provide reference for effective prevention and control of COVID-19. Methods The investigation of field epidemiology and cluster epidemic was used to describe the distributions of all COVID-19 cases. The time sequence diagram of the cases, disease onset was drawn and transmission chains were analyzed. Real-time RT-PCR assay was conducted for SARS-CoV-2 nucleic acid test by using the respiratory samples of the cases. Results The COVID-19 epidemic, originated from a wholesale farm produce market (market X) in Fengtai District, Beijing, was introduced by a marketer in the market Y who had exposed to market X, causing 8 clusters of 20 confirmed cases of COVID-19 and one asymptomatic case, including 8 men and 13 women, in market Y, surrounding communities, food plaza, companies, families and other places. The incidence peaked during June 10-14, 2020; the median age of the cases was 45 years, ranging from 5 years to 87 years. The initial symptoms of the cases included fever (10/20) and pharynx discomfort (7/20). The median of incubation period was 5 days (IQR: 3-8). The median of serial interval between primary case and secondary cases was 5 days with a secondary attack rate of 3.7%(20/538), and the secondary attack rate in household close-contacts was 14.0% (7/50). Conclusions The clusters of COVID-19 associated with market Y were caused by several modes of transmission, including human-to-human, contaminated material-to-human, etc. The combined public-health response measures were effective to control the COVID-19 epidemic in Haidian district of Beijing.
Key words: COVID-19    Cluster    Transmission chains    

新型冠状病毒(新冠病毒)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)已构成全球大流行,我国采取的非药物性综合防控措施有效遏制了疫情蔓延,但全国时有散发病例和聚集性疫情发生[1-2]。2020年6月,北京市发生1起COVID-19聚集性疫情,以丰台区某农产品批发市场(X市场)为感染源头,波及北京市11个区和5个省份。截至7月10日,北京市共发生29起聚集性疫情,共报告COVID-19确诊病例335例、无症状感染者33例[2-3]。本调查分析一起海淀区某商品交易市场(Y市场)聚集性疫情,为COVID-19疫情防控提供参考依据。

对象与方法

1. 调查对象:来源于中国疾病预防控制信息系统COVID-19个案报告卡、现场流行病学调查及个案调查。截至2020年7月10日,与Y市场聚集性疫情有流行病学关联的COVID-19病例和密切接触者。

2. 调查方法和内容[4]:采用现场流行病学和聚集性疫情调查方法,包括个案调查、信息报告及查阅病历等方式收集病例发病及就诊、流行病学史、密切接触者等信息。根据Y市场指示病例发病日期,向前推1个最长潜伏期(14 d),最早暴露时间估计为2020年5月30日。依靠北京市海淀区公安机关开展大数据排查,根据手机信号搜索5月30日及以后到过Y市场的人员,由属地街道协调社区居委会配合开展病例搜索和相关人员筛查。个人信息予以保密,剔除身份证号、职业等敏感信息。

3. 实验室检测[4]:采集调查对象的呼吸道标本(咽拭子和深咳痰液),冷藏条件下送至CDC检测。采用北京市CDC统一配发的试剂盒(均在效期内),新冠病毒核酸提取采用RNA提取试剂盒[罗氏诊断产品(上海)有限公司生产],核酸检测采用实时荧光RT-PCR法(上海伯杰医疗科技有限公司生产)。所有检测操作流程均参照试剂盒的使用说明。

4. 相关定义:COVID-19聚集性疫情、确诊病例、无症状感染者、密切接触者等定义参照文献[4]。①指示病例:此次疫情出现的、对启动疫情调查有指示作用的首位病例;②首发病例:造成本次疫情传播的第1位病例,即一代病例;③潜伏期:对单次暴露的病例计算潜伏期,潜伏期=发病日期-暴露日期,采用中位数和四分位间距(IQR)描述;④代间距[5]:原发病例的发病日期与其传染导致的续发病例发病日期的间隔时间,对单次单源暴露病例计算代间距,代间距=第n+1代发病时间-第n代发病时间,对同代病例代间距采用中位数描述;⑤续发率[6]:1个最长潜伏期内所有密切接触者中被首发病例传染而发病人数占比,续发率(%)=续发感染数/密切接触者总数×100%。

5. 统计学分析:采用Excel 2016软件建立数据库,描述COVID-19病例三间分布等流行病学特征,绘制和分析病例发病时序图和传播链示意图。病例发病时序图以时间为横轴,以可能的最早暴露日期为起点,每位病例均标注暴露、发病、确诊、隔离、入院及出院日期;以时间为横轴,按照不同感染来源绘制传播链示意图。

结果

1. 疫情概述:X市场报告COVID-19疫情后,海淀区立即开展重点人群及相关人员筛查及病例搜索工作,在6月12日发现Y市场1例无症状感染者后,海淀区迅速采取相关防控措施(图 1),新冠病毒核酸筛查共51 333人(Y市场相关人员589人、周边封控10个社区居民34 893人、密切接触者538人、5月30日及其后到过Y市场人员15 313人)。截至2020年7月10日,海淀区共报告Y市场关联性COVID-19确诊病例20例和无症状感染者1例。其中,暴露史来源分别为X市场1例、Y市场6例、与首发病例共同居住及到过筒子楼7例、家庭内传播7例。续发率为3.5%(19/538),家庭密切接触者续发率为14.0%(7/50)。

图 1 北京市Y市场COVID-19聚集性疫情发病时间及防控措施

21例病例中,男性8例,年龄中位数45岁,年龄范围5~87岁,现住北京市20例,发病时间主要集中在6月10-14日(11/21)。确诊病例中,以轻型和普通型为主(17/20),重/危重型3例;首发症状以发热为主(10/20),体温范围37.3 ℃~38.5 ℃,其他症状包括咽部不适7例,畏寒3例,头痛、咳嗽和肌肉酸痛各2例,鼻塞、打喷嚏、流涕和乏力各1例。病例发现方式以密切接触者、市场和社区核酸筛查为主(17/21),主动就医4例。海淀区在关闭Y市场并实施防控措施后,最后1例病例经过1个潜伏期(14 d)后,无新发病例报告,截至8月4日所有病例均痊愈出院。

2. 采样及检测:采集51 333名相关人员呼吸道标本,核酸检测阳性17例。在Y市场、筒子楼、美食城、病例生活环境(包括马桶、垃圾桶、门把手和下水口等)采集外环境涂抹样本954件,检出阳性样本4件,其余均为阴性。

3. 传播链调查:本次聚集性疫情包括2起公共场所、1起社区、1起单位和4起家庭聚集(图 23)。

注:病例编号按病例报告时间顺序;指示病例:病例1;首发病例:病例2;病例11为公司聚集病例 图 2 Y市场COVID-19聚集性疫情传播链示意图
图 3 北京市Y市场COVID-19聚集性疫情时序图

(1) Y市场疫情:Y市场共5个厅(仅5号厅经营水产、禽肉和蔬菜),从业人员155人。病例1~5均为5号厅从业人员;病例13和14为顾客;病例20和21为病例2的亲属。

① 病例1为猪肉商户(指示病例),于6月12日新冠病毒核酸检测阳性,13日诊断为无症状感染者,其家人于6月5日购买病例2摊位冻虾;②病例3为水产商户(首发病例),每日去X市场进货,进货摊位6人中有5人陆续确诊(最早于6日发病),排除其他感染来源,判定病例3感染来源于X市场;③病例2为水产商户,与病例3邻摊,其丈夫每日去X市场并与病例3在同一摊位进货;④病例4为鸡肉商户,与病例2、3摊位同排;⑤病例5为蔬菜商户,6月13日新冠病毒核酸检测阳性,与病例1、2和3均无密切接触;⑥病例13于6月6日在病例4摊位买菜,病例14于6月5日在病例2和3的邻摊买菜,感染可能来源于Y市场;⑦病例20和21是病例2亲属,感染来源于家庭聚餐或共同生活。

(2) 社区疫情:病例6~10为Y市场周边封控社区居民,均无Y市场暴露史,与病例3居住在同一栋筒子楼内。该筒子楼每层20多户,共用卫生间及水房,卫生条件极差且通风不良。6月1日起,该筒子楼东侧卫生间和水房改造,住户在各楼层间共用卫生间、水房,病例6~10可能在共用卫生间或水房时暴露于病例3或其污染的环境;病例6和10为父子,不排除家庭内传播。

(3) 单位疫情:病例11和12为母女,共同居住,病例6和11为同事,判断其感染来源于病例6,并通过家庭聚集传播给病例12。

(4) 美食城疫情:病例15和19是美食城生意合伙人,病例16~18是病例15亲属。6月12日美食城内部停水,卫生间无法使用,病例15和19到病例3居住的筒子楼如厕,筒子楼的感染传播可能性较大,但不排除病例19与病例15的接触感染。

4. 感染来源分析:

(1) 仅1例病例有X市场暴露史,最初感染来源为X市场。

(2) Y市场:①按传染期为发病前2 d考虑,推测病例14于6月5日到访Y市场前,该市场已存在其他未知传染源;②大数据排查未发现其他关联性病例,推测Y市场外环境在6月5日前可能被污染,病例1、2、4和5可能在Y市场疫情初期就存在暴露风险,潜在暴露日期为5月30日;③病例13和14可能暴露于Y市场被污染的环境而被感染;④Y市场环境及物品未检出新冠病毒阳性标本,经物传人的证据不足,无法判断病例13和14的感染来源,推测病例3在潜伏期早期具有传染性,Y市场疫情初期不排除人传人的可能,病例2和3摊位相邻,可能病例3在潜伏期内感染病例2。

(3) 筒子楼:二层男卫生间检出新冠病毒核酸阳性样本,病例在各楼层间共用卫生间,除病例6和10外,各病例互不认识,无密切接触,考虑筒子楼外环境被污染,病例因接触污染物表面而感染,不排除人传人的可能。

5. 传播代际分析:本次疫情共传播4代,一代病例为病例3,二代病例为暴露于Y市场及病例3居住环境的病例,共12例,三代病例7例,四代病例1例。

6. 潜伏期:7例为单次暴露,潜伏期2~10 d,中位数5(IQR:3~8)d。

7. 代间距:本疫情有2起聚集疫情中的2个三代病例为单次单源暴露,能够明确代际传播,代间距为分别为4、6 d,中位数5 d。

8. 续发率:总续发率3.7%(20/538),家庭密切接触者续发率14.0%(7/50)。

讨论

X市场接触者流动到Y市场后,通过污染环境、物品、人员接触等方式,导致Y市场从业人员4名和顾客2名发病,引起周边社区、美食城等聚集性发病。疫情出现后,海淀区及时采取防控措施,包括关闭高风险公共场所、封闭管控重点社区、人群大规模核酸筛查、集中隔离和医学观察等措施,有效阻断了疫情的进一步传播。

病例3居住的筒子楼较为陈旧,卫生条件差,卫生间物表涂抹样本检出新冠病毒核酸阳性,提示该筒子楼环境物表被污染,新冠病毒可能通过共用卫生间传播,接触病毒污染的物品也可造成感染[4]。新冠病毒在空气及气溶胶中、铜制材料表面可存活3~4 h,在硬纸板、不锈钢、塑料表面可存活24~72 h[7]。虽然长时间近距离接触为主要传播途径,但接触公共物品可导致接触传播[8]。2020年7-9月大连市、青岛市发生的COVID-19疫情中,通过现场流行病学调查和基因测序等手段,均证实存在经物传人的传播方式[9-10]。因此,有必要加强公共区域和公用物品表面的消毒,降低间接接触传播的风险。

COVID-19病例在潜伏期末期具有传染性[11-12]。病例2无X市场暴露史,未发现其他感染来源,在首发病例出现症状前1 d发病,摊位相邻,推测病例3可能在潜伏期内感染病例2。

COVID-19病例平均发病前3 d,即具有传染性[13-14];另有报道,2例处于潜伏期的病例从发病前6 d的咽拭子标本中分离到病毒,其中1例在发病前7 d核酸检测呈阳性[15]。因此,尽管目前已明确COVID-19病例在潜伏期就具有传染力,但是潜伏期内的感染期长短及其传染性强弱目前尚无定论[5]。本疫情病例13、14于首发病例发病前3~4 d暴露于Y市场,在病例3摊位附近买菜,无近距离接触,感染来源不明确,新冠病毒感染者在潜伏期早期是否具有传染性有待进一步证实。

Li等[16]对武汉市早期COVID-19病例传播动力学分析的文献显示,5起独立的聚集性疫情中能够明确代际关系的6例病例的代间距为3~9 d。本调查中二、三代病例代间距中位数为5 d,与其报道相似。

本次疫情采用大数据排查方式,及时发现续发病例并使其得到有效管控。大数据排查能快速寻找暴露人群,对疫情精准防控起到重要的作用;重点人员核酸筛查,对潜在病例的识别起到了关键作用。目前疫情应对中,大数据排查、重点人员核酸筛查是行之有效的防控措施。

近期我国多个口岸进口冷链食品外包装检测出新冠病毒[17],多地报道经物传人的COVID-19疫情[9-10],针对上述情况,我国已组织多个部门开展人物同防等防控措施,加强冷链食品行业的监测。为及时甄别、发现COVID-19疫情,应加强对农贸市场、超市等场所的疫情监测,开展冷链食品的检测,做好相关人员的健康监测,强化公共场所的日常消毒、居住场所的环境整治;COVID-19的常态化防控形势下,需加强公众的健康指引和防病宣传,以减少和避免聚集性疫情的发生。

本调查存在不足。①未开展新冠病毒基因测序;②Y市场可能存在环境及物品污染,但该市场外环境未检出新冠病毒阳性样本;③回顾性的调查可能存在回忆偏倚;④21例病例中,仅7例为单次暴露,2例为单次单源暴露,对潜伏期和代间距的计算可能存在影响。

综上所述,Y市场COVID-19疫情为一起通过被污染环境、物品、人员接触等多种暴露方式导致的聚集性疫情,北京市海淀区通过综合防控措施使疫情得到有效控制。

利益冲突  所有作者均声明不存在利益冲突

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