陈亮,严延生,翁育伟,王惠榕,吴守丽,陈舸,郑兆双,郑健,颜苹苹.异源双链泳动分析法在人类免疫缺陷病毒1基因亚型分析中的应用[J].中华流行病学杂志,2002,23(2):127-130 |
异源双链泳动分析法在人类免疫缺陷病毒1基因亚型分析中的应用 |
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收稿日期:2001-03-30 出版日期:2014-09-18 |
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中文关键词: 人类免疫缺陷病毒 异源双链泳动分析 基因亚型 序列测定 |
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目的 运用异源双链泳动分析法 (HMA)进行人类免疫缺陷病毒 1(humanimmunodeficiencyvirus 1,HIV 1)基因亚型分析,了解福建省HIV 1亚型的流行情况。方法 收集细胞培养中HIV 1感染的外周血单个核细胞 (PBMC),聚合酶链反应 (PCR)扩增HIV 1膜蛋白基因(env)区的核酸片段,与标准亚型的对照质粒的PCR产物进行杂交,形成异源双链二聚体,根据其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的泳动率确定其亚型,并进一步对标本进行序列测定和系统树分析。结果15份标本中,80.0 0 %为E亚型,6.6 7%为B亚型,2份不能确定其亚型。比较异源双链泳动法和序列测定法的结果,显示两种分析方法对HIV 1病毒基因分型有较高的一致性,其亚型一致率为86.6 7%。结论 福建省流行的HIV 1毒株以E亚型为主。亚型分析法具有快速、简便、经济和高特异性的特点,可用作对HIV流行毒株进行长期监测的重要手段。 |
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