文章摘要
王铖,戴俊程,孙义民,谢兰,潘良斌,胡志斌,沈洪兵.遗传风险评分的原理与方法[J].中华流行病学杂志,2015,36(10):1062-1064
遗传风险评分的原理与方法
Genetic risk score:principle,methods and application
投稿时间:2015-06-15  
DOI:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2015.10.005
中文关键词: 遗传易感因素;风险评分;疾病预测模型
英文关键词: Genetic susceptibility factor;Risk score;Disease prediction model
基金项目:国家自然科学基金重点项目(81230067);江苏高校优势学科建设工程专项资金(公共卫生与预防医学)
作者单位E-mail
王铖 211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系  
戴俊程 211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系  
孙义民 博奥生物集团有限公司  
谢兰 清华大学医学院医学系统生物学研究中心  
潘良斌 博奥颐和健康科学技术有限公司  
胡志斌 211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系  
沈洪兵 211166 南京医科大学公共卫生学院流行病学系 hbshen@njmu.edu.cn 
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中文摘要:
      遗传风险评分用于评价遗传易感因素在风险预测模型中的效果。常用的遗传风险评分方法主要有5种:简单相加遗传风险评分,以OR值作为权重的遗传风险评分,直接基于logistic回归的遗传风险评分,多基因遗传风险评分,可释方差遗传风险评分。本文介绍这几种方法的计算模型、适用条件、优势及局限性。随着更多易感位点的引入,模型复杂性也随之增大,一些新方法已经开发出来以解决这一难题,但是其应用效果有待后续研究评估。
英文摘要:
      Genetic risk score(GRS) is used for evaluating the effects of genetic susceptible factors in risk prediction models. Five methods are commonly used for GRS:i.e. simple count genetic risk score (SC-GRS),odds ratio weighted genetic risk score (OR-GRS),direct logistic regression genetic risk score(DL-GRS),polygenic genetic risk score(PG-GRS) and explained variance weighted genetic risk score(EV-GRS). This paper summarizes the models,application conditions,advantages and limitations of the five methods. The complexity of prediction models increased along with the inclusion of more susceptible SNPs,some method have been developed to solve the problems,but the effects of new methods needs further evaluation.
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