文章摘要
蒋方圆,王丽娟,孙静,余丽丽,周璇,朱益民,李雪.全表型组关联研究方法学研究进展[J].中华流行病学杂志,2022,43(7):1154-1161
全表型组关联研究方法学研究进展
Research progress in the methodology used in phenome-wide association studies
收稿日期:2021-11-04  出版日期:2022-07-15
DOI:10.3760/cma.j.cn112338-20211104-00853
中文关键词: 全表型组关联研究  生物医疗大数据  电子化病历  多效性
英文关键词: Phenome-wide association study  Biomedical big data  Electronic medical records  Pleiotropy
基金项目:
作者单位E-mail
蒋方圆 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058  
王丽娟 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058  
孙静 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058  
余丽丽 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058  
周璇 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058  
朱益民 浙江大学医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系, 杭州 310058  
李雪 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系, 杭州 310058 xueli157@zju.edu.cn 
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中文摘要:
      全表型组关联研究(PheWAS)是一种反向遗传学分析方法,旨在研究哪些表型可能与给定的遗传变异相关联。随着生物医疗数据库和电子病历信息的开放获取,PheWAS已逐渐成为探索暴露因素与多种健康结局之间关联的有效方法。这种方法具有同时探索某一种暴露与多种疾病表型之间的统计学关联的独特优势,从而有助于揭示多重因果关联以及各疾病间共同的致病机制。然而,PheWAS目前也面临诸多挑战。该方法本身存在一定的局限性,包括工具变量的选择是否具有代表性以及繁重的多重校正负担。此外,如何应用生物学知识阐释研究结果是PheWAS的另一重点问题。本文将围绕PheWAS方法学进行概述,以期为后续更好地开展PheWAS提供思路和建议。
英文摘要:
      Phenome-wide association study (PheWAS) is a reverse genetic analysis method to identify the potential phenotypes associated with genetic variations. With the increasing availability of biomedical databases and electronic medical records (EMR), PheWAS has gradually become an effective tool to unveil the relationships between exposure and a broad range of health phenotypes. The unique advantage of this method is that it can simultaneously explore the associations of a specific exposure with a variety of disease outcomes, thus helping to reveal multiple causal relationships and the shared pathogenic mechanisms among diseases. However, PheWAS has limitations, including selecting instrumental variables and the heavy burden of various corrections. In addition, how to interpret the biological mechanisms underlying significant findings is another crucial issue of PheWAS. This review will focus on the methodology and application of PheWAS to provide meaningful suggestions and insights for future studies.
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