文章摘要
李允文,邵一鸣,罗小光,苏玲,张流波,陈均,方越,袁健中,张艺,陈惠萍,Josef Kostler,Hans Wolf.湖北省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析[J].中华流行病学杂志,1997,18(4):217-219
湖北省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析
Subtype and Sequence Analysis of the C2-V3 Region of gp120 Genes among HIV-1 Strains in Hubei Province
收稿日期:1997-03-03  出版日期:2021-06-09
DOI:
中文关键词: HIV-1;亚型;基因变异;序列测定
英文关键词: HIV-1;Subtype;Gene variation;Sequencing
基金项目:
作者单位
李允文 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
邵一鸣 中国预防医学科学院病毒所艾滋病参比实验室 
罗小光 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
苏玲 中国预防医学科学院病毒所艾滋病参比实验室 
张流波 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
陈均 中国预防医学科学院病毒所艾滋病参比实验室 
方越 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
袁健中 中国预防医学科学院病毒所艾滋病参比实验室 
张艺 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
陈惠萍 湖北省卫生防疫站 武汉 430070 
Josef Kostler 德国累根斯堡大学医学微生物学研究所 
Hans Wolf 德国累根斯堡大学医学微生物学研究所 
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中文摘要:
      1996年8月下旬采集20份湖北省HIV-1感染者外周血,分离单个核细胞(PBMCs)提取核酸使用PCR进行扩增获得HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区350~450个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明,这20份样品均为B亚型的HIV-1毒株序列,彼此间的基因离散率为1.9%。与国际A-E亚型参考序列及部分地区B亚型代表株序列相比较,湖北的20个毒株与流行与我国云南德宏、四川和河南等地的B亚型毒株序列十分接近,均属于泰国B亚型;它们的基因离散率在1.9%~3.2%的范围内。根据以上数据及其它资料提示,HIV-1在湖北的流行时间不长,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关。
英文摘要:
      Twenty DNA fragments of HIV-1 env gene were amplified by PCR from uncultured peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) obtained from HIV-1 sero positive people from Hubei province in the end of 1996.The C2-V3 region (about 450 bp) was sequenced.Sequence analyses showed that all of them were HIV-1 subtypes,B strain,with 1.9% gene divergence innergroup.The 20 subtype B strains,compared with sequences of several reference HIV-1 strains,were closely related to those found in Thailand,Myanma and Yunnan and other provinces in China.The nucleotide sequence divergence between them ranged from 1.9% to 3.2%. These results suggested that recent epidemic of B subtype HIV-1 strains in Hubei province and the responsible virus were very close to those identified in Yunnan province.
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